Trochę uprościłem i uogólniłem sprawę takim tytułem. Bardziej chodzi mi o wykorzystanie szeroko pojętych technologii semantycznych w inżynierii biomedycznej i biocybernetyce. Niektórzy specjaliści, moim zdaniem w znacznej mierze słusznie, wyraźnie oddzielają metody tworzenia i wykorzystywania ontologii dla celów naukowych od tych tworzonych dla tzw. celów administracyjnych np. biznesowych oraz od tych stanowiących realizację koncepcji Semantic Web. Rozwiązania naukowe i administracyjne charakteryzują się znacznie większą dyscypliną tworzenia i regułami rozwoju od potencjalnie swobodnych i samoregulujących się baz wiedzy opartych na koncepcji Semantic Web.
Wygląda na to, że badacze z zakresu medycyny, podobnie jak badacze z dziedzin związanych z szeroko pojętym bezpieczeństwem narodowym, dość szybko zainteresowali się technologiami semantycznymi. Trudno się dziwić. Mają do czynienia z poważnymi problemami opisanymi potężną liczbą danych rozproszonych globalnie i wzajemnie niekompatybilnych. Dość łatwo wyobrazić sobie jakie zalety może mieć połączenie rozsianych po całym świecie medycznych baz danych. Pokaże krótko gdzie można poczytać o tych pracach.
Do najbardziej uznanych przedsięwzięć zalicza się np. OBO Foundry czyli Open Biomedical Ontologies. To solidna, otwarta baza ontologii z zakresu medycyny. Można brać i używać. Wśród projektów powiązanych z OBO występuje jedno z największych przedsięwzięć w tej dziedzinie czyli Gene Ontology (GO), którego celem jest standaryzowanie reprezentacji genów i atrybutów produktów genowych u różnych gatunków roślin i zwierząt.
W wiele projektów związanych z projektowaniem, budową i utrzymywaniem ontologii na potrzeby medycyny zaangażowany jest Barry Smith z University of New York w Buffalo. Warto zajrzeć na jego stronę tutaj. Niezbyt piękna, ale treściwa. Dostępne są tam również wykłady na video. Warto poświęcić parę godzin na obejrzenie. Dobra angielszczyzna, do tego slajdy do pobrania. Kawał solidnej wiedzy. Video z jednego z kursów nie działa – napisałem w tej sprawie – jeśli coś będę wiedział, dam znać.
W Polsce też trochę się już w tej dziedzinie dzieje. Ostatnio natknąłem się na pracę ONTOLOGIA MAMMOGRAFII – STRUKTURA MODELU, DEFINICJE I INSTANCJE POJĘĆ napisaną przez Teresę Podsiadły-Marczykowską z IBIB PAN oraz Annę Guzik z Zakładu Radiologii Szpitala Grochowskiego przy ul. Grenadierów w Warszawie.
Istotną cechą prac z zakresu semantyzacji wiedzy medycznej jest połączenie jej z systemami elektronicznego zapisu zdrowia pacjenta (ang. EHR – electronic health record). Ale to już oddzielny temat. 
